七百年前，世界政府過度發展，引發能源浩劫與污染風暴，以前所未見的毀滅力量反撲文明——人類科技倒退至中古世紀，黑色瘴氣覆蓋大氣層外，日光不再伸手可得。爭奪僅存「日光地」與光暈之力的亂世，自此而始。
劇情時間線
一條依官方劇情推敲的世界大事時序，由上而下即時間先後。標「交會點」者為三陣營在同一時刻交織之處；各陣營章節掛在對應大事下，點章可直跳任務頁。跨陣營的精確同時性遊戲未硬性定義，此為策展推敲、仍在校正中。
遠古
浩劫之後數百年，哈斯卡以帝王之姿，集合地球上殘存的科學技術建立帝國，此後以武力征伐各個擁有日光地的部落、對人類施行高壓統治。帝國「哈斯卡皇族」自此承不老不死的血脈——後世的阿波羅與雅堤米絲即其雙生子女。失光而活於影中者於幽閉中悟道，興為天影武士、組「天影十字軍」以抗強權；於戰爭夾縫求生者，則成第三勢力傭兵。三方為僅存的日光地鏖戰數十年，鼎立之勢就此成形。
傭兵團「七手」馬茲席塔由一部古書悟得分魂離魄之術，將心神裂為三位各有人格的自己——力量最霸道的「元體」、陰氣最盛、承其內心黑暗的「元精」、沉靜如空、能三元歸一的「元靈」。出關之際，元體將元精、元靈鎖入希瓦地城，潛心研習元素大法；冰、火、雷、闇、木五行之力，日後凝成「元體舍利」。
九方一色少年時是皇家騎士團裡阿波羅的換帖兄弟，後離開皇家、於中央大陸北方寒地自立為一國之君。其獨女「冰玉王女」九方織夢離家出走，隨一名外地青年（即日後的隱居士「青嵩散人」）投身傭兵團、闖蕩江湖；二人各自秘密修練，織夢卻走火入魔，長眠於無人能進的赤焰山。青年入山尋她，與追女而來的九方一色大戰、負傷退隱，九方遂接下傭兵團「五手」之位。九方兩度求阿波羅以聖光復生術救女未果——阿波羅已向皇姊雅堤米絲立誓，絕不對人類施用復生術——二人纏鬥三十年，終立下「強押阿波羅至織夢身前，便施術救人」的約定。
第一部 · 曙光乍現
三陣營各自的出身試煉同時展開：天影武士以「破頂修羅」解放心靈與肉體、貫通天影之氣；皇家於新生訓練營鍛鍊正規軍；傭兵則在資格戰中廝殺求存、爭奪唯一的入團名額。
烽火在大陸各處點燃，三方各自鋪陳。天影平定艾爾瑪的盜賊之亂，又循傳說穿越迷霧森林、闖聖塔那古火山，探尋地火靈魂（火舍利初現）；皇家馳援阿薩斯危城，追查城主暗研的上古冰劍之祕；傭兵團則奉命狙殺地球復原組織（EBO）的高級科學家多倫大公。
紅河流域風雲驟起。傭兵團在「浣熊村」設活體實驗村、煉製噬魂秘藥；帝國紅三角洲的駐地人員一夜離奇消失，帝國、天影、傭兵團三方互相猜忌，於此爆發「紅三角戰役」。天影循秘藥追入紅河古墓，傳奇的影俠為阻屍血蟲外流、下洞堵口，自此失蹤成謎；傭兵這頭綁走基因權威阿曼達博士，玩家卻因放走博士反遭傭兵團「黑色追殺令」。三條線在紅河交織。
約十年後
第二部 · 屠魔英雄
紅三角戰役後，帝國著手重奪外海的藍星島。隨後戰場各地靈體暴走，受封天位騎士的玩家習「封靈光印」鎮壓群靈，於索爾之門力戰黑炎大將軍九方一色；皇姊雅堤米絲於尼斯水宮被九方擄走，玩家隨阿波羅元帥直搗赤焰魔山，斬不動佛、喚醒長眠的赤焰王女九方織夢——九方一色與阿波羅的三十年舊約，至此牽動全局。